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我國完成小麥A基因組測序和圖譜繪制

2018-05-14 11:39:23    佘惠敏

北京時間5月10日凌晨1時,國際頂級學術刊物《自然》在線發(fā)表了我國科學家完成小麥A基因組測序和精細圖譜繪制的研究論文。該項研究全面揭示了小麥A基因組的結構和表達特征,對深入系統(tǒng)研究麥類植物的結構與功能基因組學,以及進一步推動栽培小麥的遺傳改良具有重要理論意義和實用價值。此項研究由中國科學院遺傳與發(fā)育生物學研究所植物細胞與染色體工程國家重點實驗室、中國科學院種子創(chuàng)新研究院和遺傳發(fā)育所基因組分析平臺等合作完成。

小麥是全球最重要的糧食作物,養(yǎng)活了世界上40%的人口,提供了人類所需熱能和蛋白質(zhì)的20%。我國是世界上小麥生產(chǎn)和消費大國,常年種植面積為2400萬公頃左右,年產(chǎn)量近1.3億噸。

生產(chǎn)上廣泛種植的普通小麥是一個經(jīng)兩次自然雜交而形成的異源六倍體,含有A、B和D3個基因組,約17Gb,是水稻基因組的40倍;且其基因組復雜,85%以上基因組DNA為重復序列;這使得基因組測序研究困難重重,進展緩慢。追本溯源,烏拉爾圖小麥是普通小麥和其他多倍體小麥中A基因組的原始二倍體供體。因此,烏拉爾圖小麥在多倍體小麥進化過程中,起著基礎性核心作用。

研究團隊在前期小麥A基因組草圖繪制基礎上,通過構建A基因組BAC文庫和BAC測序,結合全基因組PacBio測序以及最新物理圖譜構建技術,繪制出小麥A基因組7條染色體的分子圖譜,注釋出了41507個蛋白編碼基因,并發(fā)現(xiàn)在小麥基因組中,參與春化和開花的REM類轉錄因子基因有明顯擴增。

通過與水稻、高粱和短柄草基因組的比較和共線性分析,研究團隊推演出小麥A基因組7條染色體的進化模型,并鑒定出小麥A基因組從二倍體、經(jīng)四倍體到六倍體進化過程中的染色體結構變異。群體遺傳學分析顯示,來自于新沃月地區(qū)的烏拉爾圖小麥可分為3個亞群,其遺傳多樣性與海拔高度密切相關,并證明海拔高度在烏拉爾圖小麥適應環(huán)境和重要性狀形成中,起到重要作用。

小麥A基因組測序和精細圖譜繪制的完成,為國內(nèi)外科研工作者解析小麥基因組進化和馴化提供了高質(zhì)量的基因組信息和一個全新視角。注釋出的基因信息將助力小麥重要農(nóng)藝性狀基因的精細定位、克隆和功能解析,加速栽培小麥的遺傳改良和分子設計育種,對提升小麥產(chǎn)業(yè)競爭力、保障糧食安全和農(nóng)業(yè)提質(zhì)增效與可持續(xù)發(fā)展,將產(chǎn)生重要作用。

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